Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DEPDC5O75140 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DEPDC5O75140 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DEPDC5O75140 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DEPDC5O75140 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms