Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CUTAO60888 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUTAO60888 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUTAO60888 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUTAO60888 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUTAO60888 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUTAO60888 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUTAO60888 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUTAO60888 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUTAO60888 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUTAO60888 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUTAO60888 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUTAO60888 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUTAO60888 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUTAO60888 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUTAO60888 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUTAO60888 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUTAO60888 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUTAO60888 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CUTAO60888 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUTAO60888 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUTAO60888 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUTAO60888 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUTAO60888 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUTAO60888 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUTAO60888 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUTAO60888 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUTAO60888 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUTAO60888 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUTAO60888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUTAO60888 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUTAO60888 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUTAO60888 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUTAO60888 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUTAO60888 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUTAO60888 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUTAO60888 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUTAO60888 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUTAO60888 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUTAO60888 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUTAO60888 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUTAO60888 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUTAO60888 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CUTAO60888 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CUTAO60888 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUTAO60888 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUTAO60888 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CUTAO60888 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUTAO60888 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUTAO60888 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUTAO60888 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CUTAO60888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CUTAO60888 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUTAO60888 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUTAO60888 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CUTAO60888 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CUTAO60888 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CUTAO60888 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CUTAO60888 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CUTAO60888 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CUTAO60888 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CUTAO60888 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CUTAO60888 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUTAO60888 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CUTAO60888 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUTAO60888 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUTAO60888 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUTAO60888 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUTAO60888 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUTAO60888 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUTAO60888 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUTAO60888 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUTAO60888 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUTAO60888 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUTAO60888 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUTAO60888 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUTAO60888 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUTAO60888 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUTAO60888 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUTAO60888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUTAO60888 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUTAO60888 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUTAO60888 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUTAO60888 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUTAO60888 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CUTAO60888 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUTAO60888 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUTAO60888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUTAO60888 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUTAO60888 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUTAO60888 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUTAO60888 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUTAO60888 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUTAO60888 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CUTAO60888 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CUTAO60888 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUTAO60888 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUTAO60888 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUTAO60888 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUTAO60888 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms