Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PEX10O60683 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PEX10O60683 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PEX10O60683 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PEX10O60683 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX10O60683 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX10O60683 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX10O60683 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX10O60683 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PEX10O60683 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PEX10O60683 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PEX10O60683 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PEX10O60683 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PEX10O60683 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PEX10O60683 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX10O60683 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX10O60683 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX10O60683 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX10O60683 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX10O60683 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX10O60683 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX10O60683 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PEX10O60683 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PEX10O60683 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PEX10O60683 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX10O60683 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX10O60683 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX10O60683 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX10O60683 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX10O60683 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX10O60683 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX10O60683 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX10O60683 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX10O60683 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX10O60683 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX10O60683 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PEX10O60683 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PEX10O60683 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PEX10O60683 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PEX10O60683 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PEX10O60683 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PEX10O60683 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PEX10O60683 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PEX10O60683 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PEX10O60683 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PEX10O60683 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PEX10O60683 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX10O60683 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PEX10O60683 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PEX10O60683 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PEX10O60683 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX10O60683 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX10O60683 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX10O60683 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX10O60683 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX10O60683 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX10O60683 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PEX10O60683 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PEX10O60683 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PEX10O60683 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PEX10O60683 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PEX10O60683 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PEX10O60683 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PEX10O60683 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PEX10O60683 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PEX10O60683 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PEX10O60683 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PEX10O60683 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PEX10O60683 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PEX10O60683 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PEX10O60683 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PEX10O60683 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PEX10O60683 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PEX10O60683 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PEX10O60683 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PEX10O60683 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PEX10O60683 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PEX10O60683 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PEX10O60683 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PEX10O60683 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PEX10O60683 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PEX10O60683 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PEX10O60683 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PEX10O60683 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PEX10O60683 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PEX10O60683 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PEX10O60683 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PEX10O60683 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PEX10O60683 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PEX10O60683 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PEX10O60683 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX10O60683 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms