Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPLO60437 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPLO60437 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPLO60437 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PPLO60437 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPLO60437 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPLO60437 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPLO60437 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPLO60437 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPLO60437 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPLO60437 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPLO60437 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPLO60437 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPLO60437 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PPLO60437 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPLO60437 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPLO60437 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPLO60437 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPLO60437 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPLO60437 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPLO60437 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPLO60437 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPLO60437 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPLO60437 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PPLO60437 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PPLO60437 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PPLO60437 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PPLO60437 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PPLO60437 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PPLO60437 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PPLO60437 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PPLO60437 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PPLO60437 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PPLO60437 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PPLO60437 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPLO60437 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPLO60437 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPLO60437 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PPLO60437 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPLO60437 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PPLO60437 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PPLO60437 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PPLO60437 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PPLO60437 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PPLO60437 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PPLO60437 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PPLO60437 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PPLO60437 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PPLO60437 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PPLO60437 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PPLO60437 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PPLO60437 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PPLO60437 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PPLO60437 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PPLO60437 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PPLO60437 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PPLO60437 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PPLO60437 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PPLO60437 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PPLO60437 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PPLO60437 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PPLO60437 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PPLO60437 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PPLO60437 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PPLO60437 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PPLO60437 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PPLO60437 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PPLO60437 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PPLO60437 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PPLO60437 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PPLO60437 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PPLO60437 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PPLO60437 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PPLO60437 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PPLO60437 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PPLO60437 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PPLO60437 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PPLO60437 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PPLO60437 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPLO60437 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPLO60437 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPLO60437 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPLO60437 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPLO60437 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPLO60437 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPLO60437 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPLO60437 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PPLO60437 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PPLO60437 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PPLO60437 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PPLO60437 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PPLO60437 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PPLO60437 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PPLO60437 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PPLO60437 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PPLO60437 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PPLO60437 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PPLO60437 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PPLO60437 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PPLO60437 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms