Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KALRNO60229 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KALRNO60229 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KALRNO60229 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KALRNO60229 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KALRNO60229 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KALRNO60229 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KALRNO60229 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KALRNO60229 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KALRNO60229 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KALRNO60229 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KALRNO60229 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KALRNO60229 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KALRNO60229 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KALRNO60229 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KALRNO60229 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KALRNO60229 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KALRNO60229 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KALRNO60229 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KALRNO60229 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KALRNO60229 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KALRNO60229 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KALRNO60229 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KALRNO60229 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KALRNO60229 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KALRNO60229 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KALRNO60229 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KALRNO60229 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KALRNO60229 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KALRNO60229 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KALRNO60229 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KALRNO60229 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KALRNO60229 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KALRNO60229 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KALRNO60229 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KALRNO60229 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KALRNO60229 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KALRNO60229 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KALRNO60229 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KALRNO60229 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KALRNO60229 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KALRNO60229 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KALRNO60229 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KALRNO60229 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KALRNO60229 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KALRNO60229 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KALRNO60229 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KALRNO60229 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KALRNO60229 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KALRNO60229 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KALRNO60229 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KALRNO60229 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KALRNO60229 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KALRNO60229 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KALRNO60229 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KALRNO60229 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KALRNO60229 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KALRNO60229 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KALRNO60229 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KALRNO60229 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KALRNO60229 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KALRNO60229 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KALRNO60229 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KALRNO60229 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KALRNO60229 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KALRNO60229 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KALRNO60229 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KALRNO60229 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KALRNO60229 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KALRNO60229 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KALRNO60229 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KALRNO60229 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KALRNO60229 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KALRNO60229 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KALRNO60229 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KALRNO60229 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KALRNO60229 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KALRNO60229 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KALRNO60229 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KALRNO60229 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KALRNO60229 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KALRNO60229 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KALRNO60229 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KALRNO60229 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KALRNO60229 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KALRNO60229 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KALRNO60229 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KALRNO60229 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KALRNO60229 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KALRNO60229 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KALRNO60229 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KALRNO60229 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KALRNO60229 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KALRNO60229 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KALRNO60229 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KALRNO60229 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KALRNO60229 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KALRNO60229 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KALRNO60229 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KALRNO60229 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms