Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDT21O43809 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDT21O43809 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDT21O43809 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDT21O43809 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms