Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTAO43765 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTAO43765 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTAO43765 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTAO43765 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTAO43765 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTAO43765 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGTAO43765 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGTAO43765 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGTAO43765 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTAO43765 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTAO43765 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTAO43765 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTAO43765 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTAO43765 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGTAO43765 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGTAO43765 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGTAO43765 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGTAO43765 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGTAO43765 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGTAO43765 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGTAO43765 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGTAO43765 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGTAO43765 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGTAO43765 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGTAO43765 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGTAO43765 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGTAO43765 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGTAO43765 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGTAO43765 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGTAO43765 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGTAO43765 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGTAO43765 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGTAO43765 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGTAO43765 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGTAO43765 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGTAO43765 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGTAO43765 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTAO43765 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTAO43765 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGTAO43765 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGTAO43765 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGTAO43765 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGTAO43765 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SGTAO43765 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGTAO43765 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTAO43765 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTAO43765 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTAO43765 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTAO43765 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGTAO43765 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGTAO43765 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGTAO43765 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGTAO43765 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SGTAO43765 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTAO43765 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTAO43765 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTAO43765 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTAO43765 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGTAO43765 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGTAO43765 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGTAO43765 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGTAO43765 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGTAO43765 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTAO43765 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTAO43765 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTAO43765 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTAO43765 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTAO43765 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTAO43765 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTAO43765 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGTAO43765 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGTAO43765 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGTAO43765 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGTAO43765 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGTAO43765 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms