Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNGR3O43761 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR3O43761 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR3O43761 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR3O43761 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR3O43761 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR3O43761 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR3O43761 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR3O43761 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR3O43761 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR3O43761 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR3O43761 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR3O43761 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR3O43761 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR3O43761 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR3O43761 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR3O43761 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR3O43761 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR3O43761 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR3O43761 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR3O43761 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR3O43761 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR3O43761 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR3O43761 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR3O43761 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR3O43761 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR3O43761 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR3O43761 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR3O43761 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR3O43761 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR3O43761 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR3O43761 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR3O43761 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR3O43761 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR3O43761 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR3O43761 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR3O43761 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms