Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID2O43424 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID2O43424 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID2O43424 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID2O43424 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID2O43424 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID2O43424 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRID2O43424 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID2O43424 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID2O43424 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID2O43424 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRID2O43424 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRID2O43424 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID2O43424 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID2O43424 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRID2O43424 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID2O43424 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID2O43424 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID2O43424 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID2O43424 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID2O43424 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID2O43424 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID2O43424 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRID2O43424 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID2O43424 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID2O43424 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID2O43424 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID2O43424 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID2O43424 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRID2O43424 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID2O43424 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID2O43424 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID2O43424 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRID2O43424 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID2O43424 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID2O43424 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID2O43424 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID2O43424 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID2O43424 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID2O43424 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRID2O43424 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRID2O43424 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRID2O43424 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRID2O43424 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRID2O43424 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID2O43424 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID2O43424 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID2O43424 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID2O43424 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID2O43424 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID2O43424 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID2O43424 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRID2O43424 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID2O43424 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID2O43424 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID2O43424 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID2O43424 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID2O43424 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID2O43424 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID2O43424 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID2O43424 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID2O43424 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID2O43424 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID2O43424 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID2O43424 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID2O43424 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID2O43424 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID2O43424 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID2O43424 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID2O43424 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID2O43424 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID2O43424 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID2O43424 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID2O43424 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID2O43424 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID2O43424 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID2O43424 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRID2O43424 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRID2O43424 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRID2O43424 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRID2O43424 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID2O43424 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID2O43424 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID2O43424 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID2O43424 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID2O43424 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID2O43424 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID2O43424 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID2O43424 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID2O43424 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID2O43424 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID2O43424 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID2O43424 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID2O43424 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID2O43424 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID2O43424 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID2O43424 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID2O43424 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID2O43424 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID2O43424 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms