Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.545e-11■■■■■ 39.5
RBFOX2O43251 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.685e-11■■■■■ 39.5
RBFOX2O43251 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.166e-9■■■■■ 39.5
RBFOX2O43251 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.857e-10■■■■■ 39.4
RBFOX2O43251 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.137e-10■■■■■ 39.4
RBFOX2O43251 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.37e-10■■■■■ 39.4
RBFOX2O43251 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.947e-10■■■■■ 39.4
RBFOX2O43251 CALM3-203ENST00000477244 696 ntTSL 38.65□□□□□ -1.027e-10■■■■■ 39.4
RBFOX2O43251 CALM3-210ENST00000597868 927 ntTSL 38.17□□□□□ -1.17e-10■■■■■ 39.4
RBFOX2O43251 CALM3-204ENST00000482455 650 ntTSL 45.66□□□□□ -1.57e-10■■■■■ 39.4
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RBFOX2O43251 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-215ENST00000508598 570 ntTSL 414.39□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-224ENST00000515526 498 ntTSL 314.28□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-205ENST00000503127 2734 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 39.3
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RBFOX2O43251 SPATA20-209ENST00000505085 628 ntTSL 413.51□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-211ENST00000505456 878 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-216ENST00000510917 453 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-203ENST00000502911 879 ntTSL 511.79□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 SPATA20-208ENST00000504334 3539 ntTSL 210.67□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 39.3
RBFOX2O43251 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 314.06□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 39.2
RBFOX2O43251 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-11■■■■■ 39.2
RBFOX2O43251 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 39.2
RBFOX2O43251 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.951e-11■■■■■ 39.2
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RBFOX2O43251 MAGI1-211ENST00000479287 556 ntTSL 52.4□□□□□ -2.032e-13■■■■■ 39.2
RBFOX2O43251 AP3D1-212ENST00000592488 707 ntTSL 312.95□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 39.1
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RBFOX2O43251 KANSL1-204ENST00000572218 9095 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 39
RBFOX2O43251 KANSL1-234ENST00000640636 605 ntTSL 54.52□□□□□ -1.692e-10■■■■■ 39
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RBFOX2O43251 RAB11FIP3-211ENST00000495663 529 ntTSL 28.04□□□□□ -1.122e-11■■■■■ 39
RBFOX2O43251 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 314□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 39
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RBFOX2O43251 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 38.9
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RBFOX2O43251 CPED1-208ENST00000495036 2198 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 38.8
RBFOX2O43251 CPED1-209ENST00000520801 553 ntTSL 48.59□□□□□ -1.032e-10■■■■■ 38.8
RBFOX2O43251 CPED1-204ENST00000428526 2219 ntTSL 26.13□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 38.8
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RBFOX2O43251 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 38.8
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RBFOX2O43251 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-9■■■■■ 38.8
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RBFOX2O43251 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 38.8
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RBFOX2O43251 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.496e-9■■■■■ 38.8
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RBFOX2O43251 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.597e-17■■■■■ 38.8
RBFOX2O43251 PPP4C-203ENST00000562222 742 ntTSL 318■□□□□ 0.477e-17■■■■■ 38.8
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RBFOX2O43251 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-17■■■■■ 38.8
RBFOX2O43251 PPP4C-210ENST00000567040 879 ntTSL 213.12□□□□□ -0.317e-17■■■■■ 38.8
RBFOX2O43251 ALB-212ENST00000507673 262 ntTSL 23.68□□□□□ -1.822e-21■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 MYO9A-206ENST00000563542 8864 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.561e-9■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 MYO9A-204ENST00000561618 4784 ntTSL 1 (best)4.23□□□□□ -1.731e-9■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-206ENST00000462976 794 ntTSL 518.07■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-204ENST00000443813 591 ntTSL 415.17■□□□□ 0.021e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-209ENST00000478560 782 ntTSL 515.02■□□□□ -01e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-221ENST00000512922 1134 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-218ENST00000507067 342 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.151e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-213ENST00000504648 2435 ntTSL 213.89□□□□□ -0.191e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-215ENST00000506215 435 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-202ENST00000419301 949 ntTSL 512.22□□□□□ -0.451e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 CDK18-219ENST00000507240 351 ntTSL 34.61□□□□□ -1.671e-10■■■■■ 38.7
RBFOX2O43251 MZF1-AS1-203ENST00000600726 559 ntTSL 411.51□□□□□ -0.574e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 MZF1-AS1-201ENST00000593642 565 ntTSL 37.79□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 38.6
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