RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505559.5

SPATA20-212, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 2

Gene SPATA20, Length 1,590 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-212ENST00000505559 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.25■■■■■ 6.28
SPATA20-212ENST00000505559 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.97■■■■■ 5.27
SPATA20-212ENST00000505559 ABCC9O60706 1549 aa46.81■■■■■ 5.08
SPATA20-212ENST00000505559 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.36■■■■■ 4.85
SPATA20-212ENST00000505559 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
SPATA20-212ENST00000505559 NACADO15069 1562 aa45.03■■■■■ 4.8
SPATA20-212ENST00000505559 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.01■■■■■ 4.8
SPATA20-212ENST00000505559 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.79■■■■■ 4.76
SPATA20-212ENST00000505559 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.78■■■■■ 4.76
SPATA20-212ENST00000505559 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.14■■■■■ 4.66
SPATA20-212ENST00000505559 SCRIBQ14160 1630 aa43.99■■■■■ 4.63
SPATA20-212ENST00000505559 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.86■■■■■ 4.61
SPATA20-212ENST00000505559 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.75■■■■■ 4.59
SPATA20-212ENST00000505559 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.29■■■■■ 4.52
SPATA20-212ENST00000505559 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.71■■■■■ 4.43
SPATA20-212ENST00000505559 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
SPATA20-212ENST00000505559 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.34■■■■■ 4.37
SPATA20-212ENST00000505559 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.3■■■■■ 4.36
SPATA20-212ENST00000505559 SMARCA4P51532 1647 aa42.03■■■■■ 4.32
SPATA20-212ENST00000505559 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
SPATA20-212ENST00000505559 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.9■■■■■ 4.3
SPATA20-212ENST00000505559 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.71■■■■■ 4.27
SPATA20-212ENST00000505559 SMARCA2P51531 1590 aa41.6■■■■■ 4.25
SPATA20-212ENST00000505559 NCAPD3P42695 1498 aa41.57■■■■■ 4.25
SPATA20-212ENST00000505559 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.53■■■■■ 4.24
SPATA20-212ENST00000505559 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
SPATA20-212ENST00000505559 WIZO95785 1651 aa41.49■■■■■ 4.23
SPATA20-212ENST00000505559 HMGXB3Q12766 1538 aa41.38■■■■■ 4.21
SPATA20-212ENST00000505559 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
SPATA20-212ENST00000505559 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
SPATA20-212ENST00000505559 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SPATA20-212ENST00000505559 NESP48681 1621 aa40.64■■■■■ 4.1
SPATA20-212ENST00000505559 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.54■■■■■ 4.08
SPATA20-212ENST00000505559 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.42■■■■■ 4.06
SPATA20-212ENST00000505559 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.41■■■■■ 4.06
SPATA20-212ENST00000505559 CFTRP13569 1480 aa40.25■■■■■ 4.03
SPATA20-212ENST00000505559 ERCC6Q03468 1493 aa40.24■■■■■ 4.03
SPATA20-212ENST00000505559 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.13■■■■■ 4.01
SPATA20-212ENST00000505559 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.12■■■■■ 4.01
SPATA20-212ENST00000505559 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.98■■■■□ 3.99
SPATA20-212ENST00000505559 PRDM2Q13029 1718 aa39.95■■■■□ 3.99
SPATA20-212ENST00000505559 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.87■■■■□ 3.97
SPATA20-212ENST00000505559 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
SPATA20-212ENST00000505559 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.73■■■■□ 3.95
SPATA20-212ENST00000505559 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
SPATA20-212ENST00000505559 WDR62O43379 1518 aa39.59■■■■□ 3.93
SPATA20-212ENST00000505559 CUX2O14529 1486 aa39.58■■■■□ 3.93
SPATA20-212ENST00000505559 TOPBP1Q92547 1522 aa39.39■■■■□ 3.9
SPATA20-212ENST00000505559 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.33■■■■□ 3.89
SPATA20-212ENST00000505559 CUX1P39880 1505 aa39.27■■■■□ 3.88
SPATA20-212ENST00000505559 ABCC8Q09428 1581 aa39.27■■■■□ 3.88
SPATA20-212ENST00000505559 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.11■■■■□ 3.85
SPATA20-212ENST00000505559 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
SPATA20-212ENST00000505559 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.06■■■■□ 3.84
SPATA20-212ENST00000505559 SYNJ1O43426 1573 aa39.06■■■■□ 3.84
SPATA20-212ENST00000505559 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.99■■■■□ 3.83
SPATA20-212ENST00000505559 IFT140Q96RY7 1462 aa38.98■■■■□ 3.83
SPATA20-212ENST00000505559 TOP2BQ02880 1626 aa38.96■■■■□ 3.83
SPATA20-212ENST00000505559 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.95■■■■□ 3.83
SPATA20-212ENST00000505559 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
SPATA20-212ENST00000505559 SOGA1O94964 1423 aa38.92■■■■□ 3.82
SPATA20-212ENST00000505559 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
SPATA20-212ENST00000505559 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.75■■■■□ 3.797e-8■■■□□ 18.3
SPATA20-212ENST00000505559 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
SPATA20-212ENST00000505559 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
SPATA20-212ENST00000505559 WDR97A6NE52 1622 aa38.69■■■■□ 3.78
SPATA20-212ENST00000505559 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.63■■■■□ 3.77
SPATA20-212ENST00000505559 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.48■■■■□ 3.75
SPATA20-212ENST00000505559 TRIM41Q8WV44 630 aa38.48■■■■□ 3.75
SPATA20-212ENST00000505559 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.47■■■■□ 3.75
SPATA20-212ENST00000505559 PBRM1Q86U86 1689 aa38.39■■■■□ 3.74
SPATA20-212ENST00000505559 GRIN2BQ13224 1484 aa38.38■■■■□ 3.73
SPATA20-212ENST00000505559 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.35■■■■□ 3.73
SPATA20-212ENST00000505559 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.29■■■■□ 3.72
SPATA20-212ENST00000505559 FBLN2P98095 1184 aa38.23■■■■□ 3.71
SPATA20-212ENST00000505559 KIF27Q86VH2 1401 aa38.22■■■■□ 3.71
SPATA20-212ENST00000505559 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
SPATA20-212ENST00000505559 CHD1O14646 1710 aa38.2■■■■□ 3.71
SPATA20-212ENST00000505559 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.17■■■■□ 3.7
SPATA20-212ENST00000505559 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.15■■■■□ 3.7
SPATA20-212ENST00000505559 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 SYNJ2O15056 1496 aa38.09■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 ADAMTS12P58397 1594 aa38.09■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 IGF1RP08069 1367 aa38.08■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 OSCARQ8IYS5 282 aa38.08■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.03■■■■□ 3.68
SPATA20-212ENST00000505559 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38■■■■□ 3.67
SPATA20-212ENST00000505559 GRIN2AQ12879 1464 aa37.92■■■■□ 3.66
SPATA20-212ENST00000505559 CUL7Q14999 1698 aa37.87■■■■□ 3.65
SPATA20-212ENST00000505559 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.85■■■■□ 3.65
SPATA20-212ENST00000505559 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.65
SPATA20-212ENST00000505559 CEP170Q5SW79 1584 aa37.77■■■■□ 3.64
SPATA20-212ENST00000505559 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.73■■■■□ 3.63
SPATA20-212ENST00000505559 NUP160Q12769 1436 aa37.71■■■■□ 3.63
SPATA20-212ENST00000505559 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.68■■■■□ 3.62
SPATA20-212ENST00000505559 EEA1Q15075 1411 aa37.64■■■■□ 3.62
SPATA20-212ENST00000505559 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.63■■■■□ 3.61
SPATA20-212ENST00000505559 PRXQ9BXM0 1461 aa37.61■■■■□ 3.61
SPATA20-212ENST00000505559 ARHGEF11O15085 1522 aa37.5■■■■□ 3.59
SPATA20-212ENST00000505559 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.48■■■■□ 3.59
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