Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEFVO15553 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEFVO15553 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEFVO15553 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEFVO15553 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEFVO15553 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEFVO15553 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEFVO15553 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEFVO15553 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MEFVO15553 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEFVO15553 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEFVO15553 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEFVO15553 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEFVO15553 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEFVO15553 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MEFVO15553 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEFVO15553 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEFVO15553 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEFVO15553 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEFVO15553 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEFVO15553 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEFVO15553 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEFVO15553 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEFVO15553 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEFVO15553 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEFVO15553 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEFVO15553 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEFVO15553 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MEFVO15553 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MEFVO15553 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEFVO15553 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEFVO15553 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEFVO15553 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEFVO15553 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEFVO15553 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEFVO15553 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEFVO15553 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEFVO15553 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEFVO15553 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEFVO15553 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEFVO15553 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MEFVO15553 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEFVO15553 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEFVO15553 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEFVO15553 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEFVO15553 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEFVO15553 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MEFVO15553 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEFVO15553 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEFVO15553 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MEFVO15553 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEFVO15553 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEFVO15553 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEFVO15553 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEFVO15553 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MEFVO15553 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEFVO15553 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEFVO15553 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEFVO15553 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEFVO15553 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEFVO15553 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEFVO15553 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEFVO15553 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEFVO15553 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEFVO15553 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEFVO15553 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEFVO15553 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEFVO15553 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEFVO15553 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEFVO15553 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MEFVO15553 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEFVO15553 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEFVO15553 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEFVO15553 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEFVO15553 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEFVO15553 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEFVO15553 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEFVO15553 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MEFVO15553 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MEFVO15553 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEFVO15553 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEFVO15553 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEFVO15553 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms