Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FANCAO15360 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FANCAO15360 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
FANCAO15360 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
FANCAO15360 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
FANCAO15360 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
FANCAO15360 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
FANCAO15360 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
FANCAO15360 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
FANCAO15360 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FANCAO15360 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FANCAO15360 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FANCAO15360 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FANCAO15360 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FANCAO15360 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
FANCAO15360 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
FANCAO15360 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FANCAO15360 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
FANCAO15360 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FANCAO15360 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FANCAO15360 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FANCAO15360 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FANCAO15360 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FANCAO15360 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FANCAO15360 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FANCAO15360 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCAO15360 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
FANCAO15360 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
FANCAO15360 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FANCAO15360 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FANCAO15360 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
FANCAO15360 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FANCAO15360 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
FANCAO15360 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
FANCAO15360 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
FANCAO15360 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
FANCAO15360 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
FANCAO15360 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
FANCAO15360 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
FANCAO15360 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FANCAO15360 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
FANCAO15360 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
FANCAO15360 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
FANCAO15360 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
FANCAO15360 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FANCAO15360 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
FANCAO15360 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FANCAO15360 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FANCAO15360 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
FANCAO15360 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
FANCAO15360 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
FANCAO15360 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
FANCAO15360 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
FANCAO15360 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
FANCAO15360 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FANCAO15360 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FANCAO15360 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
FANCAO15360 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
FANCAO15360 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FANCAO15360 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FANCAO15360 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FANCAO15360 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FANCAO15360 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FANCAO15360 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FANCAO15360 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FANCAO15360 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FANCAO15360 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FANCAO15360 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FANCAO15360 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FANCAO15360 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FANCAO15360 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FANCAO15360 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FANCAO15360 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
FANCAO15360 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
FANCAO15360 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
FANCAO15360 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
FANCAO15360 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
FANCAO15360 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
FANCAO15360 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
FANCAO15360 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FANCAO15360 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FANCAO15360 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FANCAO15360 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FANCAO15360 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FANCAO15360 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
FANCAO15360 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
FANCAO15360 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
FANCAO15360 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
FANCAO15360 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FANCAO15360 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
FANCAO15360 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
FANCAO15360 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms