Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC1O15269 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPTLC1O15269 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTLC1O15269 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTLC1O15269 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms