Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEMA3EO15041 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA3EO15041 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA3EO15041 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms