Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3R1O14745 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3R1O14745 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms