Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD8O14715 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD8O14715 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD8O14715 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD8O14715 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD8O14715 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD8O14715 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD8O14715 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD8O14715 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD8O14715 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RGPD8O14715 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD8O14715 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD8O14715 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD8O14715 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD8O14715 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD8O14715 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD8O14715 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD8O14715 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD8O14715 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD8O14715 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD8O14715 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD8O14715 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD8O14715 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD8O14715 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RGPD8O14715 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.76■■■■□ 3
RGPD8O14715 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RGPD8O14715 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms