Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXLO00592 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXLO00592 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXLO00592 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXLO00592 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXLO00592 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXLO00592 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXLO00592 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXLO00592 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXLO00592 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXLO00592 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXLO00592 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXLO00592 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXLO00592 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXLO00592 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXLO00592 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXLO00592 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PODXLO00592 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXLO00592 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXLO00592 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXLO00592 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXLO00592 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXLO00592 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXLO00592 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXLO00592 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXLO00592 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXLO00592 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXLO00592 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXLO00592 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXLO00592 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXLO00592 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXLO00592 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXLO00592 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXLO00592 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXLO00592 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXLO00592 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXLO00592 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXLO00592 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXLO00592 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXLO00592 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXLO00592 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXLO00592 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXLO00592 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXLO00592 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXLO00592 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXLO00592 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXLO00592 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXLO00592 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXLO00592 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXLO00592 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXLO00592 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXLO00592 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXLO00592 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXLO00592 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXLO00592 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXLO00592 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXLO00592 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXLO00592 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXLO00592 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXLO00592 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXLO00592 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXLO00592 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXLO00592 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PODXLO00592 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PODXLO00592 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PODXLO00592 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PODXLO00592 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PODXLO00592 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PODXLO00592 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PODXLO00592 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PODXLO00592 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PODXLO00592 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PODXLO00592 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PODXLO00592 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PODXLO00592 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PODXLO00592 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms