Protein–RNA interactions for Protein: O00308

WWP2, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP2O00308 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WWP2O00308 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WWP2O00308 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WWP2O00308 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WWP2O00308 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WWP2O00308 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WWP2O00308 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WWP2O00308 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WWP2O00308 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WWP2O00308 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WWP2O00308 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WWP2O00308 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WWP2O00308 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WWP2O00308 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WWP2O00308 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WWP2O00308 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WWP2O00308 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WWP2O00308 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WWP2O00308 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WWP2O00308 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WWP2O00308 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WWP2O00308 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WWP2O00308 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WWP2O00308 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WWP2O00308 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WWP2O00308 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WWP2O00308 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WWP2O00308 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WWP2O00308 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WWP2O00308 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WWP2O00308 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP2O00308 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP2O00308 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP2O00308 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP2O00308 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP2O00308 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP2O00308 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP2O00308 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP2O00308 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP2O00308 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP2O00308 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP2O00308 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP2O00308 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP2O00308 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP2O00308 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP2O00308 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP2O00308 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP2O00308 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
WWP2O00308 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP2O00308 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP2O00308 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP2O00308 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP2O00308 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP2O00308 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP2O00308 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP2O00308 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP2O00308 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP2O00308 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP2O00308 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP2O00308 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP2O00308 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP2O00308 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP2O00308 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP2O00308 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP2O00308 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP2O00308 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP2O00308 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WWP2O00308 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WWP2O00308 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WWP2O00308 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WWP2O00308 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WWP2O00308 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WWP2O00308 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WWP2O00308 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WWP2O00308 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WWP2O00308 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WWP2O00308 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WWP2O00308 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WWP2O00308 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WWP2O00308 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WWP2O00308 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WWP2O00308 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WWP2O00308 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms