Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD11O00231 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD11O00231 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD11O00231 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms