Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms