Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DSR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DSR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DSR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DSR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DSR2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DSR2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DSR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DSR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DSR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DSR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DSR2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DSR2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DSR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DSR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DSR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DSR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DSR2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DSR2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DSR2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DSR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DSR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DSR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DSR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DSR2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DSR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DSR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DSR2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DSR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DSR2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DSR2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DSR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DSR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DSR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DSR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DSR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DSR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DSR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DSR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DSR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DSR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DSR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DSR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DSR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DSR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DSR2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DSR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DSR2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DSR2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DSR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DSR2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DSR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B4DSR2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
B4DSR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
B4DSR2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
B4DSR2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DSR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DSR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DSR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DSR2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DSR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B4DSR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B4DSR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms