Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KNCNA6PVL3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms