Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200CA6NKL6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM200CA6NKL6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms