Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOL1A6NHN0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOL1A6NHN0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOL1A6NHN0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOL1A6NHN0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms