Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1LA6NDD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNDIG1LA6NDD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms