Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MAP1LC3B2A6NCE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAP1LC3B2A6NCE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms