Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRBA1A5PL33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRBA1A5PL33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRBA1A5PL33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms