Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM221AA4D161 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM221AA4D161 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms