Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC162PA2VCL2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC162PA2VCL2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms