Protein–RNA interactions for Protein: A2A288

ZC3H12D, Probable ribonuclease ZC3H12D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12DA2A288 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC3H12DA2A288 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC3H12DA2A288 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms