Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ09

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ09 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A1W2PQ09 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A1W2PQ09 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A1W2PQ09 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A1W2PQ09 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A1W2PQ09 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A1W2PQ09 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1W2PQ09 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A1W2PQ09 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms