Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVT2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1B0GVT2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVT2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1B0GVT2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms