Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAARA0A1B0GVQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPAARA0A1B0GVQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPAARA0A1B0GVQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPAARA0A1B0GVQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms