Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PARPBPQ9NWS1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PARPBPQ9NWS1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms