Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUP35Q8NFH5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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