Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATL3Q6DD88 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms