Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPD7Q5XG87 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms