Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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