Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms