Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GADD45AP24522 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms