Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms