Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAPAQ9P0L0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms