Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms