Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms