Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms