Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms