Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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