Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHC1Q5JVL4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms