Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE3BQ13370 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms